在1月7日召开的2013年全国卫生工作会议上，卫生部部长陈竺在报告中提到，要继续深化医改，按照“保基本、强基层、建机制”的原则，抓住关键问题，完善政策措施，更加注重提高服务质量和改革效果。陈竺要求各单位确定各项改革发展路线图和时间表，把各项任务细化为年度工作指标，倒排时间表。
　　回顾2012年卫生工作，陈竺说，2012年是深化医改承上启下的关键之年，中央财政总共投入243亿元用于完善医疗卫生服务体系建设，卫生部牵头的33项任务顺利完成。深化医改重点工作全面推进，医疗卫生服务能力和安全质量得到提升，重大疾病防控、卫生应急和妇幼卫生成效显著，食品药品安全监管和卫生监督执法全面加强，中医药工作更加注重服务基层、贴近群众，人才科教信息等其他工作发挥重要支撑作用。
　　陈竺认为，“2012年取得的新进展和新成绩不仅是过去一年努力工作的结果，也是近几年深化医改成果的反映。深化医改确立的为人民健康服务的改革方向和2020年人人享有基本医疗卫生服务的奋斗目标，使我国卫生改革发展理念和思路更加明确。”
　　当前，改革已经进入深水区和攻坚期，“我们要按照中央的总体布局和要求推进医疗保障、医疗服务、公共卫生、药品供应和监管体制五个领域的综合改革。”陈竺说。
　　在深化改革方面，陈竺透露，新版基药目录有望在今年公布，2013年，基层医疗卫生机构将全部配备使用基本药物；二级医院基本药物使用量和销售额都应达到40%~50%，其中县级医院综合改革试点县的二级医院应达到50%左右；三级医院基本药物销售额要达到25%~30%。
　　在卫生行政体制建设方面，陈竺表示，要加快推进新型城镇化、统筹城乡经济社会发展的总体要求，遵循统一、高效、协调的原则，整合基本医疗保障制度筹资、服务、经办和管理职能，形成责任主体明确、管理服务高效、利于控制费用、统筹协调发展的卫生行政管理体制。
　　此外，会议对10位“白求恩奖章”获得者、197个全国卫生系统先进集体和580位先进工作者、100个全国新型农村合作医疗工作先进集体和200位先进个人进行了表彰。