城市副中心站综合交通枢纽工程处于副中心“一带一轴”空间结构交汇处,总用地范围约70公顷,建成后将成为亚洲最大地下综合交通枢纽。该项目是北京唯一连接两大国际机场的铁路综合枢纽,也是副中心唯一连接京津冀和城市中心区的换乘枢纽。它连接M6线、平谷线、M101线三条轨道交通线路和京唐铁路、京哈铁路、城际联络线三条铁路线路,通过京唐、京滨城际、城际铁路联络线可以实现2分钟到达副中心行政办公区。